本故事发生于五、六十年代的香港。
　　邓伟祥﹝郭晋安饰﹞奉母遗愿，从内地到港投靠未来外父凌醒波﹝秦煌饰﹞。谁知找波不果，惟先找到表叔邓镜尘﹝马国明饰﹞投靠。尘是个通天经纪，终日营营役役，朝不保夕。机缘巧合下，尘从一寻人广告中，得知祥之未来外父竟是富商波。尘不惜借下大耳窿雷贵利，教祥讹称有钱仔，一起往见未来外父。不料，被波妻－林兰卿﹝卢宛茵饰﹞认定祥存心白撞，把祥、尘赶走，祥误会被卿嫌弃家贫，自尊心受损，忿然离去。雷上门追债，祥以事情因自己而起，决为尘还债，尘感动，于是两老表同捞同煲，齐齐搵食。
　　祥的同屋住郑碧云﹝胡杏儿饰﹞与弟郑小龙﹝林泳东饰﹞相依为命。云原于波之花露水厂打工，因厂长公报私仇，藉词辞退云，云逼于无奈，只好暂时到舞厅任女侍应。另方面，祥之未婚妻凌凤﹝江芷妮饰﹞因不愿婚姻大事被父母安排，离家出走。奶妈黎雯娣﹝夏萍饰﹞安排凤暂住板间房，与祥等成为同屋住。凤对祥产生好感。而尘亦被凤之青春美丽吸引。祥把信物交尘拿去典当应急还债，巧遇波，波认出信物，误把尘认作未来女婿。卿契仔谢君绵﹝黎耀祥饰﹞献计找其"表妹" 狄丽娜﹝黄泆潼饰﹞扮作凤，以应付及试探尘，尘被娜美色吸引。
　　云辞去舞厅工作后，到大笪地卖唱，因其鬼马扮相及悦耳歌喉，颇受捧场客欢迎。在南洋富商陆恭﹝李成昌饰﹞介绍之下，得以转到歌厅献唱，祥更把所作新歌赠予云试唱，谁知云竟因而大受欢迎。祥、云志趣相投，感情大进。尘得悉娜也是冒名顶替后，得知祥之未婚妻竟便是凤，不由惊喜交杂。祥在片场被炒，来到波之花露水厂打工，凤为了搏取祥之好感，随祥到父所开之工厂打工。另方面，凤为免身份败露，不时要避开绵父兼厂长谢鲁泉﹝黎彼得饰﹞，险象环生。
　　时波发觉花露水厂盈利骤减，波决命尘代为调查。泉得知尘之"钦差"身份，极力巴结，另方面则隐瞒自己之罪证。泉亏空公款事败，最终被炒，但凤之真正身份亦由是通天。祥得知真相，勃然大怒，尘则力言冒认祥只因对凤一往情深。凤得知自己之真正未婚夫竟便是祥，喜出望外。云惊悉祥早有未婚妻，伤心欲绝。绵心恐凤当真会嫁给祥，坏了自己大事，不惜利用娜色诱祥，反令自已与娜之暧昧关系曝光，卿得知绵助波金屋藏娇，一怒之下，把绵赶走。
　　绵、泉怀恨在心，转投敌对之花露水洋行，抢走波不少生意。祥、尘帮手救亡，灵机一触，二人反串以"马姐"形象成为花露水特别商标，风靡了香港万千马姐，令得波之花露水销路激增。凤找云摊牌，直言云跟祥一起，只会影响祥之大好前途，云因爱祥，甘心退出，假意与一直追求自己之南洋富商相好，令祥死心。此时龙竟被证实患上急性心脏病，需要一大笔金钱来作手术费，云救龙心切，决嫁予恭。祥为免云断送终身幸福，毅然答应与凤结婚，向波借取巨款给龙做手术。
　　时花露水厂再面临经济困境，尘献计派美女代表花露水参加工展小姐，如能胜出，定可大收广告之效，云答应代表波之花露水厂参选。泉、绵怀恨在心，竟当向公众踢爆云曾做过舞女之事，祥鼓励云挺身而出，坦承当日只是为势所逼，结果反令云在工展小姐选举中胜出。云助祥解救了花露水厂危机，以祥与凤婚礼在即，决抽身离去，谎称对演艺事业意兴阑珊，决追随恭嫁到南洋去，祥虽大受打击。
　　祥在新婚之夜，向凤承诺，此后定会尽心尽力爱凤。凤心知祥、云实是真心相爱，明白到爱不是占有，于是讲出真相，祥得以及时赶到码头追回云，有情人终成眷属。祥因所作之花露水广告歌受到注目，得以踏足乐坛，与云组成一时无两之夫妻档。尘决脚踏实地，在工厂由低层做起，向凤证明诚意，凤亦答应给尘一次机会。

　　沈思晨（叶璇 饰）是一个奋发向上的预备律师，却因为一件小事导致无法在法律界立足。得到师傅介绍进入保险业大公司MIG工作，与同事韩志坚（黄浩然 饰）擦出爱火花，好胜的她也凭借自己的努力证明给上司余紫珊（张文慈 饰）看自己的实力。这时大老板程万豪（谢贤  饰）的大儿子程乐天从美国回来，对思晨一见钟情。韩志坚为了自己的前途，放弃思晨。伤心的思晨投入了乐天的怀抱，直至知道自己原来是程万豪的私生女，唯有与乐天分手。
　　韩志坚无穷的欲望开始爆发，与程乐儿结婚并夺取MIG的控制权，更嫁祸给拍档毕城辉，让他替自己背黑锅。此事被乐天发现后，韩志坚更不惜杀人灭口。程万豪被连串打击弄至中风，韩志坚的势头无法可挡，坚韧的思晨决定为父亲报仇，从志坚手中夺回失去的一切，无论是MIG，还是正义和公道。

　　万家和（陈锦鸿 饰）是一名心理医生，他十分热爱自己的职业，也因为能够帮助他人走出心理疾病的困扰而充满了喜悦与自豪。可是，万家和能够医治别人，却医治不了自己，曾经的一场意外让他对男女之事充满了恐惧，也正因为此，从小到大，他从来就没有享受过一段长久而又稳定的恋情。
　　一位名叫应灵山（滕丽名 饰）的女孩出现在了万家和的生命之中，令万家和十分心动，然而，就在万家和以为自己终于找到真爱之时，他的好友张祖尧（郑嘉颖 饰）却半路杀出横刀夺爱。与此同时，应灵山被查出患上了精神分裂症，在各方压力之中，万家和能否化险为夷呢？

　　5年前，殷婷（苏玉华饰）在台湾因杀害丈夫刘启忠（温兆伦饰）而被判刑，因行为良好5年后被提早释放。回到香港的她挣扎着开始新的生活，在热心帮助母亲的罗理浩（林保怡饰）律师手下做事。未几，发现与丈夫长得一模一样的阮文山（温兆伦饰），现在俨然是天堃太子女的未婚夫，在殷婷的纠缠下，阮文山处处证明了自己并不是她丈夫。当淑娴带着儿子从美国回港那天起，事情的真相被逐渐揭开，她喊文山老公，而孩子喊他爸爸，5年前的罪恶被重新勾起。
　　理浩的女儿患上了蚕豆症，这种带有遗传基因的病显示好友游尚志才是女儿的亲生父亲！这一真相的显现，令游尚志决定夺回自己的爱人与女儿，把理浩逼上绝路。
　　殷婷与理浩决定反击，复仇。

　　沈思晨（叶璇 饰）是一个奋发向上的预备律师，却因为一件小事导致无法在法律界立足。得到师傅介绍进入保险业大公司MIG工作，与同事韩志坚（黄浩然 饰）擦出爱火花，好胜的她也凭借自己的努力证明给上司余紫珊（张文慈 饰）看自己的实力。这时大老板程万豪（谢贤  饰）的大儿子程乐天从美国回来，对思晨一见钟情。韩志坚为了自己的前途，放弃思晨。伤心的思晨投入了乐天的怀抱，直至知道自己原来是程万豪的私生女，唯有与乐天分手。
　　韩志坚无穷的欲望开始爆发，与程乐儿结婚并夺取MIG的控制权，更嫁祸给拍档毕城辉，让他替自己背黑锅。此事被乐天发现后，韩志坚更不惜杀人灭口。程万豪被连串打击弄至中风，韩志坚的势头无法可挡，坚韧的思晨决定为父亲报仇，从志坚手中夺回失去的一切，无论是MIG，还是正义和公道。

　　梁赞原为戏班伙头，自小随省城戏班大花脸黄华宝学习“咏春”功夫，因抱打不平，在满洲高手隆科贝克面前展现身手，引来高手向其师黄华宝挑战。
　　黄华宝虽一再避战，最终仍被隆科贝克暗算重伤，梁赞愤然...

　　林一江（陶大宇 饰）遇见薛水（陈豪 饰）时感到是上天最大的恩赐，因薛水是一江十三岁时失散的亲弟弟，多年来一直对此满怀愧疚的一江提议要把薛水接回家住，一家人齐齐整整。然而一江独力养大的弟弟二洋（苏志威 饰）、四海和妹妹小湖（唐诗咏 饰）却各有自己的意见。
　　邻居开心（郭可盈 饰）开了一家花茶店，无奈客人惨淡。热心的一江落力帮忙，然而开心和薛水互相吸引，成人之美的一江选择退出。谁知敏感的开心与薛水性格差异极大，反而薛水和开心的妹妹——毫无心机的美丽（廖碧儿 饰）相处起来快乐得多。开心这时也才发现，一江才是和自己最配对的人。无奈皇天最爱开玩笑，一江当年的挚爱碧芬返港了，一江开始弄不清出自己的感情……

　　鸭寮街是香港的缩影，随着香港经济起落，它亦经历过由欣欣向荣的黄金年代，沦为二手货交易市场的命运。
　　金融风暴前，戴少良的高级音响专门店是鸭寮街内最大的一家，其好友成大志因投机坐拥过千万的身家；金融风暴后，少良生意大不如前，大志亦沦为负资产。唯独二人好友关炳仁脚踏实地，不受影响。三人虽背景回异，但交情甚笃，热爱足球，三人组成的球队，在区内更被冠以「鸭记风尘三侠」的称号。
　　国际名导演卫家明女友卓琳为电影美指，为电影到鸭寮街搜集资料。她遇上少良，发现他一直怀缅过去的原因，原来少良七年前曾与歌影红星卓宁有一段七日情缘。自此，少良认定那段时期是他人生最风光的时刻，事业、爱情皆得意。虽事隔多年，并未与时并进。

　　豪庭烧鹅海鲜酒家的大少爷游学澧（林峰饰）被家人认定是一事无成的阔少爷，他总希望能够证明自己的能力。乐观坚强的周文希（佘诗曼饰）多年来一直与母亲相依为命。乐于助人的陈家乐（郑嘉颖饰）出生于市井平民的家庭，但乐天知命，为人洒脱。生性柔弱怯懦的周芷茵（杨怡饰）一直肩负着养家的重任，帮助父亲打理运输公司。四个本不相识的香港年轻人，在一场由香港电视台与新加坡电视台合办的美食竞赛“Yummy Yummy美食终极大竞赛”中相识相知，从最初的意见不合，到后来的几经患难，彼此间都建立了互信互助的友情。不仅如此，四人更与来自新加坡的王福生（杨志龙饰）成为了好朋友。比赛结束之后，五位年轻人交织在爱情与事业中的人生故事旋即上演。

　　明朝时期有一名女飞贼飞鹰（米雪 饰）劫富济贫，神捕陆战（元华 饰）也被她的风姿吸引，两人结合后生下一女，名叫陆拾义（周丽淇 饰），飞鹰也就此在江湖销声匿迹。长大后的拾义成为了一名女捕快，处处为百姓伸张正义，却被衙门中的男人看轻。刚好新上任的县令水东流整治官员中腐败现象，便与拾义联手破解了多宗奇案。
　　就在这个时候发生的一宗谋杀案，嫌疑犯锁定在飞鹰身上。母亲隐瞒多年的身份终于被拾义妹知道了。拾义妹为了帮飞鹰洗脱罪名，决定与水东流一起寻找真凶。

　　鸭寮街是香港的缩影，随着香港经济起落，它亦经历过由欣欣向荣的黄金年代，沦为二手货交易市场的命运。
　　金融风暴前，戴少良的高级音响专门店是鸭寮街内最大的一家，其好友成大志因投机坐拥过千万的身家；金融风暴后，少良生意大不如前，大志亦沦为负资产。唯独二人好友关炳仁脚踏实地，不受影响。三人虽背景回异，但交情甚笃，热爱足球，三人组成的球队，在区内更被冠以「鸭记风尘三侠」的称号。
　　国际名导演卫家明女友卓琳为电影美指，为电影到鸭寮街搜集资料。她遇上少良，发现他一直怀缅过去的原因，原来少良七年前曾与歌影红星卓宁有一段七日情缘。自此，少良认定那段时期是他人生最风光的时刻，事业、爱情皆得意。虽事隔多年，并未与时并进。

　　最近，在甜品界中出现了一个“罗宾汉”，常常给陷入困境的人们送美味的蛋糕加油打气，人人都知道“蛋糕罗宾汉”，但却没有人知道这个“蛋糕罗宾汉”究竟是何方神圣。由于体质原因，高根（马德钟 饰）生来就拥有温度低于常人的双手，为他成为糕点师创造了得天独厚的条件，在一连串的波折之后，他加盟了一家大型连锁糕点店，成为了总厨。
　　在糕点店被迫关门歇业之后，唐霜（胡杏儿 饰）就一直将高根看做是始作俑者，她来到了高根的厨房之中，潜伏在他身边，准备伺机报复。然而，随着时间的推移，唐霜开始怀疑，高根就是那神出鬼没的“蛋糕罗宾汉”。

　　裁判法院法官高希敏（宣萱 饰）是个出名的钉官，铁脸无私，公正严明。潜意识里希敏不相信男人，也不相信婚姻！却想不到一次意外的邂逅，她竟然闪电结婚！令她改变初衷的，不是高大威猛的事业型男人，却是个喜欢打理家头细务凑仔煮饭的小男人葛国光（陈锦鸿 饰）。原因竟是因为一次酒后缠绵，却发现希敏怀了自己的骨肉，并打算堕胎，国光竭力阻止，并向希敏求婚，被一口拒绝。希敏为了断绝国光的纠缠，故意订立了一份非常苛刻的婚前协议书，以为用这方法可以吓走国光，想不到国光竟然毫不犹豫，立即签署！并立誓遵守协议书所有条文，令希敏大为感动，终于答应与国光结婚，并生下小儿子，开始了三小口子的幸福家庭。然而始终磨难不断。

　　年逾70的中学校长文泰来（钟景辉 饰），德高望重的他倍受人尊重。他也是家中的一家之主，家中儿子超杰（夏雨 饰）、媳妇美仙（陈秀珠）及三个孙子都对他惟命是从，称他为“太上皇”。
　　泰来对儿子颇为失望，因为超杰已经五十多岁的人，也没有多大的成就，因此他十分重视对三个孙子的教育。
　　长孙逸朗（刘凯威 饰）完成大学学业后到了一家大公司工作，正好被调回香港，泰来对这个孙子十分满意，所以他对长孙疼爱有加。次孙逸晞（方力申 饰）刚从大学毕业，虽然积极寻找工作，但始终没得到就业机会。最小的孙子逸清（陈宇琛 饰）刚刚读大学，好动贪玩，也有许多让泰来看不惯的坏习惯，泰来与他极难沟通。
　　泰来常以过来人的身份，教育孙子们如何处理生活中遇到的大小事。

　　画家郑板桥（王喜 饰）怀揣着报效国家的远大理想来到了扬州，期望自己能够在此施展抱负，然而现实残酷，等待着他的是不断的挫折和失败。终于，郑板桥如愿以偿进入了官场，却发现其中贪官污吏横流，完全不是他所想象的模样。
　　在扬州，郑板桥邂逅了名为王一姐（黎姿 饰）的青楼女子，被其可怜的身世所打动，两人坠入了情网，然而这段感情遭到了王一姐之母的反对和阻挠，最终，郑板桥含恨娶了自己并不喜欢的徐氏（陈松伶 饰）为妻。在两人朝夕相处的日子里，善良温柔的徐氏渐渐获得了郑板桥的真心，可是，在一场意外中，徐氏为救郑板桥而死，临终前，她恳求郑板桥同饶五妹（胡杏儿 饰）结为夫妻。

　　明朝时期有一名女飞贼飞鹰（米雪 饰）劫富济贫，神捕陆战（元华 饰）也被她的风姿吸引，两人结合后生下一女，名叫陆拾义（周丽淇 饰），飞鹰也就此在江湖销声匿迹。长大后的拾义成为了一名女捕快，处处为百姓伸张正义，却被衙门中的男人看轻。刚好新上任的县令水东流整治官员中腐败现象，便与拾义联手破解了多宗奇案。
　　就在这个时候发生的一宗谋杀案，嫌疑犯锁定在飞鹰身上。母亲隐瞒多年的身份终于被拾义妹知道了。拾义妹为了帮飞鹰洗脱罪名，决定与水东流一起寻找真凶。

　　林一江（陶大宇 饰）遇见薛水（陈豪 饰）时感到是上天最大的恩赐，因薛水是一江十三岁时失散的亲弟弟，多年来一直对此满怀愧疚的一江提议要把薛水接回家住，一家人齐齐整整。然而一江独力养大的弟弟二洋（苏志威 饰）、四海和妹妹小湖（唐诗咏 饰）却各有自己的意见。
　　邻居开心（郭可盈 饰）开了一家花茶店，无奈客人惨淡。热心的一江落力帮忙，然而开心和薛水互相吸引，成人之美的一江选择退出。谁知敏感的开心与薛水性格差异极大，反而薛水和开心的妹妹——毫无心机的美丽（廖碧儿 饰）相处起来快乐得多。开心这时也才发现，一江才是和自己最配对的人。无奈皇天最爱开玩笑，一江当年的挚爱碧芬返港了，一江开始弄不清出自己的感情……

　　顾家源（马德钟 饰）原为一音乐教师，新婚妻子谷慧庭（宣萱 饰）在电视城担任导演，小两口甜蜜的二人世界还没享受几天，5个孩子就仿佛从天而降来到了他们的小家庭。原来，家源的姐姐、姐夫相继亡故了，唯一的亲人家源就成了姐姐5个孩子的监护人。为了不让孩子们伤心，家源骗他们说他们的父亲在遥远的非洲行医，而为了更好的照顾孩子们，家源甚至放弃了教职，而选择了工作清闲得多的在琴行担任教师。这样一间大屋内住着两家共7个人，人与人之间的摩擦、孩子们成长的烦恼共同构成了一幅幅温馨的家庭画面。

　　蓝屏(徐子珊)的男友徐风(陈键锋)失踪一年后，巡捕吕涛(黄宗泽)发现风原来已经死了，领遗体的人更是屏自己！不久，风突然出现，叫事情更加扑朔迷离，更叫屏和风已经萌芽的感情胶着。
　　一切，原来跟屏后母的布局和一个老千夺产阴谋有关。涛展开连番追查，期间险象环生，更因此而被开除，幸得跟他一起长大的殷悦妹(杨思琦)在旁鼓励。另方面，屏与风结婚后家人陆续出事。原来，以茅泰(陈鸿烈)为首的千门八将已化身不同身分渗入了蓝家……

　　年逾70的中学校长文泰来（钟景辉 饰），德高望重的他倍受人尊重。他也是家中的一家之主，家中儿子超杰（夏雨 饰）、媳妇美仙（陈秀珠）及三个孙子都对他惟命是从，称他为“太上皇”。
　　泰来对儿子颇为失望，因为超杰已经五十多岁的人，也没有多大的成就，因此他十分重视对三个孙子的教育。
　　长孙逸朗（刘凯威 饰）完成大学学业后到了一家大公司工作，正好被调回香港，泰来对这个孙子十分满意，所以他对长孙疼爱有加。次孙逸晞（方力申 饰）刚从大学毕业，虽然积极寻找工作，但始终没得到就业机会。最小的孙子逸清（陈宇琛 饰）刚刚读大学，好动贪玩，也有许多让泰来看不惯的坏习惯，泰来与他极难沟通。
　　泰来常以过来人的身份，教育孙子们如何处理生活中遇到的大小事。

　　李时珍（林文龙 饰）自由沉迷于草药研究之中，他同名为吴慕榕（李诗韵 饰）的女子先前已有婚约，却无法自持的爱上了善良美丽的阿冬（叶璇 饰）。李时珍决定将这份感情埋藏在心底，待科举考试之后向阿冬表白心意，哪知道在阴差阳错之中，他不仅没能够表白，还娶了吴慕榕为妻。
　　李时珍发现当今世上的医书错误连连漏洞百出，于是起了编撰《本草纲目》的念头。然而，他却因为个性过于耿直而得罪了权贵，使得他不得不暂时中断了医书的编撰，还性命不保踏上了逃亡的旅途。所幸有太医院的庞宪（马国明 饰）一路帮助扶持，李时珍终于完成了旷世奇作《本草纲目》。

　　香港SARS疫潮过后，人们终于从阴霾中走出来。脑外科医生程至美（吴启华饰）突然得知前女友的死讯，情绪崩溃，极度自责抑郁。法医岑雅晴（黎姿饰）伴其左右，鼓励他重新建立信心。急症室医生黎国柱（林保怡饰）结束了与女友的恋情，却卷入与骨科医生叶淘（吴美珩饰）及见习医生曾淑淇（廖碧儿饰）的三角恋中。不幸感染SARS的心脏科医生林敏智（陈豪饰）留下后遗症，为保全名声而隐瞒病情，却令病情日益恶化。妇产科医生万安生（邵美琪饰）与急症科医生向众仁（曹永廉饰）正计划共同生活，然而却因护士戴玉莹（姚嘉妮饰）的介入而面临一场情感考验。
　　由香港无线电视制作的现代时装医务纪实电视剧《妙手仁心3》是《妙手仁心》系列的第三辑，监制戚其义与编剧周旭明的黄金组合更是精心打造此辑“妙手系列”。此辑剧集在风格上延续了前两辑经典之处，一如既往的得到医务人员协助实景拍摄，继续讲述医护人员在工作中的点滴故事。

　　家家有本难念的经，何况是一个富甲天下的大家庭。王玉廷老先生（刘丹 饰）一手创立了皇庭酒店，并将其发展到5星级的连锁酒店集团，按说他的一生应该很满足，很快乐了。但是，现在他却一直为三个儿子而苦恼。长子启业（蔡子键 饰）和次子启志（莫家尧 饰）一直在为酒店的继承权斗得你死我活，两人虽然表面上和和气气，背地里却明争暗斗，这一切王老先生都看在眼里。而最令他揪心的是小儿子启杰（吴卓羲 饰），启杰一直无所事事，和街头的古惑仔无异。启杰是王老先生和何洁云生的儿子，而非正室夫人所生，所以一直都恨自己的父亲这些年来对不起他们两母子。就在这个错综复杂的家族情仇纠缠在一起的时候，王老先生去世了。
　　本以为三个儿子会斗到你死我活争夺家产，不料半路杀出一个高峰（马德钟 饰）成为了皇庭酒店的继承人。当众人还摸不着头脑时，高峰又利用手段将皇庭酒店的大部分股份弄到了手。这下，三兄弟被迫站到了同一阵线，共同对付高峰这个外来入侵者。

　　亚洲金融风暴后，甘志杰（陶大宇饰）与好友韩山（李耀祥饰）从坐拥千万家财变得一无所有，马死下地走，他们从头做起，在旅游界当导游，等待机会他朝东山再起。
　　翁家文由于丈夫外遇遭遇婚变，做惯了少奶奶的她重新适应社会，到旅行社来工作，没少给甘志杰添乱。二人却也从斗气冤家发展成为无话不谈的好朋友。
　　由于在火场中救了王金宾馆的老板金广开（胡枫饰），杰、山和家文获赠了王金宾馆的股份，但是在宾馆盈利百分之十以前不能生效。为了搞好宾馆，三人用尽心力。但是一场退伍军人疫症传来，宾馆生意一落千丈。危急时刻，杰的明星好友冬妮出现，指定入住王金宾馆并召开记者会，宾馆眼看就要起死回生。